2013年12月1日，某市政府根据城市规划进行旧城改造，决定征收城区内某处国有土地上16万㎡的房屋，其中有4万㎡的房屋未登记，包括1万㎡的违法建筑。依法选定甲房地产估价机构负责房屋征收评估工作。对4万㎡未进行登记的房屋，可以采取的处理方式为()。